Rozpoznanie gruźlicy wieku dziecięcego i ekspresji RNA gospodarza w Afryce

Potrzebne są ulepszone testy diagnostyczne na gruźlicę u dzieci. Postawiliśmy hipotezę, że sygnatury transkrypcyjne krwi żywiciela mogą być używane do odróżnienia gruźlicy od innych chorób u afrykańskich dzieci, które były zakażone lub nie były zakażone ludzkim wirusem niedoboru odporności (HIV). Metody
Badana populacja obejmowała prospektywne kohorty dzieci poddawanych ocenie pod kątem podejrzenia gruźlicy w Afryce Południowej (655 dzieci), Malawi (701 dzieci) i Kenii (1599 dzieci). Pacjenci zostali przydzieleni do grup w zależności od tego, czy rozpoznaniem była gruźlica potwierdzona przez hodowlę, gruźlica z ujemną hodowlą, choroby inne niż gruźlica czy utajone zakażenie gruźlicą. Sygnatury diagnostyczne rozróżniające gruźlicę od innych chorób i od utajonego zakażenia gruźlicą zidentyfikowano z analizy genów we wnękach ekspresji RNA we krwi gospodarza.
Wyniki
Zidentyfikowaliśmy 51-transkryptowy podpis wyróżniający gruźlicę od innych chorób u dzieci południowoafrykańskich i malawskich (kohorty odkrywczej). U dzieci w Kenii (kohorcie walidacyjnej) wynik ryzyka oparty na sygnaturze dla gruźlicy i chorobach innych niż gruźlica wykazał czułość 82,9% (95% przedział ufności [CI], 68,6-94,3) i swoistość 83,6% (95% CI, 74,6 do 92,7) do rozpoznania gruźlicy potwierdzonej przez hodowlę. Wśród pacjentów z ujemnymi wynikami badań na Mycobacterium tuberculosis, którzy byli leczeni z powodu gruźlicy (z wysoce prawdopodobnymi, prawdopodobnymi lub możliwymi przypadkami gruźlicy), szacowana czułość wynosiła odpowiednio 62,5 do 82,3%, 42,1 do 80,8% i 35,3 do 79,6%, dla różnych szacunków rzeczywistej gruźlicy w grupach. Dla porównania, czułość testu Xpert MTB / RIF do detekcji molekularnej DNA M. tuberculosis w przypadkach potwierdzonej gruźlicy potwierdzonej w hodowli wynosiła 54,3% (95% CI, 37,1 do 68,6), a czułość jest wysoce prawdopodobna, prawdopodobna lub możliwe przypadki wynosiły odpowiednio 25,0 do 35,7%, 5,3 do 13,3% i 0%; specyficzność testu wynosiła 100%.
Wnioski
Sygnatury ekspresji RNA dostarczyły danych, które pomogły w rozróżnieniu gruźlicy od innych chorób u afrykańskich dzieci zi bez zakażenia wirusem HIV. (Finansowane przez program Unii Europejskiej na rzecz walki z ubóstwem i inne).
Wprowadzenie
Rocznie diagnozuje się od 500 000 do miliona nowych przypadków gruźlicy dziecięcej, ale prawdziwe globalne obciążenie gruźlicą wieku dziecięcego jest nieznane, ponieważ często trudno jest potwierdzić diagnozę mikrobiologicznie.1-3 Chociaż większość przypadków gruźlicy u dorosłych rozpoznaje się poprzez wykrycie pałeczki kwasooporne na podstawie badania mikroskopowego próbki plwociny, w większości przypadków z dzieciństwa wymazy i hodowle są negatywne dla Mycobacterium tuberculosis, a diagnoza jest wyłącznie na podstawie klinicznej.1,3 Ponieważ objawy i objawy gruźlicy w dzieciństwie są obserwowane w wielu innych warunkach, diagnoza kliniczna jest niewiarygodna.4 Systemy oceny klinicznej zaprojektowane w celu wspomagania diagnozy nie zostały zwalidowane w stosunku do standardu diagnozy potwierdzonej przez kulturę, a dokładność diagnostyczna tych systemów różni się znacznie. 5-7 Naddiagnoza, a tym samym niewłaściwe leczenie dziecięcej gruźlicy jest powszechne.8 Z kolei niedodiagnoza przyczynia się do złego wyniku mnie, 9 i gruźlicę często identyfikuje się tylko wtedy, gdy pacjenci są krytycznie chorzy lub w trakcie badań pośmiertnych.10
Diagnostyka mikrobiologiczna dziecięcej gruźlicy zwykle wymaga przyjęcia do szpitala w celu uzyskania płynów z płukania żołądka lub plwociny wywołanej solą fizjologiczną.11 Nawet wtedy potwierdzenie mikrobiologiczne osiąga się tylko w niewielkim odsetku leczonych przypadków z powodu paucybacillarnej postaci dziecięcej gruźlicy i charakterystycznej postaci pozapłucnej. .1-3 Wyniki radiologiczne w gruźlicy wieku dziecięcego są niespecyficzne12, a próba skórna tuberkuliny i test uwalniania interferonu-? (IGRA) nie mogą odróżnić czynnej choroby od utajonego zakażenia.13 Ponadto dzieci z gruźlicą, szczególnie te, które są zarażone ludzki wirus upośledzenia odporności (HIV) lub są niedożywione, mogą mieć niereaktywne wyniki zarówno w teście skórnym tuberkulinowym, jak i IGRA.14-17. Pilnie potrzebne są udoskonalone metody diagnozowania gruźlicy dziecięcej, szczególnie w krajach Afryki Subsaharyjskiej, gdzie ciężar gruźlica i koinfekcja HIV są najwyższe.1,2,18-20 Badaliśmy t użył ekspresji genomowego RNA w krwi gospodarza, aby odróżnić gruźlicę od innych chorób, które są szeroko rozpowszechnione wśród afrykańskich dzieci zi bez zakażenia wirusem HIV, i zbadał zastosowanie oceny ryzyka choroby wynikającej z podpisu transkrypcyjnego jako podstawy do ewentualnego testu diagnostycznego .
Metody
Prowadzenie badań i nadzór
Zwerbowaliśmy pacjentów między 17 lutego 2008 r. A 27 stycznia 2011 r
[więcej w: endokrynolog kielce, lekarz sportowy, lekarz urolog ]
[podobne: glinka do picia, arsmedica, dawcy szpiku kostnego ]